第二，组成系统的各个部分（或要素）彼此之间相互作用、相互制约，形成各种不同的联系和不同的结构。上述五个子系统之间的相互作用、相互制约是显而易见的。生命的物质和结构系统可以说是其他子系统的物质、结构基础，生命的各种活动都是物质的运动、变化，都是在细胞这个基本结构单位中进行的。生命的自我更新系统可以说是其他子系统的生理基础，生命的各种活动都是在新陈代谢的基础上完成的。生命的物质、结构和生理，又都必须有增殖过程，这就是自我复制系统所完成的功能。生命物质运动、更新和各项生命活动，以及生命物质与环境之间的相互关系，都必须有自我调控系统来进行协调。生命的自我更新系统、自我复制系统、自我调控系统的功能，如果没有与环境之间的相互作用，是不可能完成的。可见，各子系统之间的联系，是系统的一个重要特征。
如果我们把五个子系统之间的联系，看成是知识系统的横向联系的话，那么，各子系统内部知识的联系可以看成是纵向联系。以第一章细胞（即生命的物质和结构系统）的内容为例，从化学元素到化合物，再到原生质，再到细胞，其纵向联系很清楚。从横向联系看，蛋白质的分子结构和功能，不但在第一章的细胞结构和分裂中有所体现，而且在第二章，即生命的自我更新系统中，体现在酶的作用和蛋白质代谢等方面；在第三章和第五章的生命的自我复制系统中，体现在染色体的规律性变化和基因控制蛋白质合成等方面；在第四章的生命的自我调控系统中，体现在某些蛋白质类激素方面；在第六章和第七章的生物与环境关系的系统中，体现在生命起源和生态系统的物质循环等方面。其他实例很多，不多列举。
上面提到的横向联系、纵向联系，以及其他一些联系，都可以看成是生物学知识系统的内部联系。生物学知识系统与其他学科知识系统的联系，则可以看成是外部联系，主要表现在生物学知识与数学、物理、化学等学科知识之间的联系。例如，蛋白质、核酸分子结构的复杂性、多样性是比较难懂的知识，如果联系化学知识、数学知识，就不难理解和掌握；遗传中的机率问题，联系数学知识也很容易理解和掌握；细胞吸水原理、物质出入细胞的三种方式、植物的蒸腾作用、能量代谢等问题，联系物理知识，就变得比较容易了。再如，联系政治课学习的一些辩证唯物主义观点来理解生物的现象和本质，就能深刻地理解，利于掌握。从上面的分析，可以看出，系统与子系统是相对的，生物学知识相对于各章节的子系统来说，它是系统，但是，相对于中学全部的知识系统来说，它又是一个子系统，这可以说是系统的另一个基本特征。
第三，组成系统的各个子系统，都由更小单位的部分（或要素）组成，反之，任何系统又是更大系统的组成部分（或要素）。或者说，任何系统按照一定的隶属关系而形成等级或形成层次。生命的物质和结构系统的层次性是极明显的，可以用下面的图表表示：
生命物质的自我更新系统，也有不同的层次，这在前面已经提到了，自我更新系统的层次与上列图表所表示的结构层次是一致的。生命物质的自我复制系统中的生殖发育过程，虽然主要是个体水平的，但是，仍然是建立在细胞水平（主要是细胞的增殖）和分子水平（主要是遗传物质的复制和蛋白质等物质的积累）基础之上的，从群体水平看，则是系统发育的层次了。生命物质的自我复制系统中的遗传和变异现象，也分成为分子遗传、细胞遗传、个体遗传和群体遗传的不同层次。生命物质与环境关系的系统中，生命起源的系统层次性主要表现在分子水平上，即生命起源化学进化过程的四个阶段；生态系统的结构和功能也有其层次。
第四，任何系统的存在和发展，必然是开放的，封闭将导致系统的崩溃和灭亡。生命系统就是个开放的系统，生命的存在和表现出各种特征，必须与周围的环境之间发生错综复杂的作用，与环境之间必须有物质、能量和信息的交流，生命才得以维持和发展。一旦生物与环境之间的交流停止了，或将生物封闭起来，则生物体内的物质和能量完全用于内耗，由于没有外来能量和物质的补充，必将导致生命物质运动的停止、生命系统的瓦解。生命系统既然是个开放系统，那么，反映生命系统的生物学知识系统，也应该是个开放系统。知识系统的开放主要体现在三个方面：学习生物学知识一定要与其他相关学科，如数、理、化等相联系，相互渗透、相互运用，这样才能学好生物学知识；学习生物学知识一定把生命系统的开放性作为我们认识生命的一个重要观点，这样在学习中才能把各子系统的知识间的相互关系注重起来，如新陈代谢的自我更新系统必然与生态系统有密切联系；学习生物学知识一定要有适合自己的思维方法和学习方法，例如，学习生物学知识的任何一部分内容，都要使知识向周围扩散，以使各部分知识都能从多侧面、多角度建立联系，此点后面还要具体地加以分析和介绍。
明确了什么是系统，以及系统的一些基本特征后，还需要学习一点系统论的几个主要原理，以指导我们的学习。
①整体原理。
整体原理对于我们的学习是有重大意义的。我们在学习高中《生物》知识的过程中，都非常重视知识的系统性、完整性和连贯性，而整体原理就把三方面统一起来。整体原理说的是，任何系统都是有结构的，都是有内部联系的，从而使各个部分联接成一个整体，并且系统整体的功能不等于各孤立部分功能之和，即
我们学习的高中《生物》的知识系统就是一个知识的整体，同样，其中第一章的生命的物质和结构系统，也是一个知识系统的整体，其他章节的知识系统也是个整体。整体中各部分之间通过各种联系而形成了整体的知识结构、知识系统。例如，高中《生物》第二章生物的新陈代谢，如前面所说，是生命物质的自我更新系统。这一系统是由绿色植物的新陈代谢和高等动物的新陈代谢，这两个大的部分组成的，而其中绿色植物的新陈代谢又由一些更小的部分构成，可用下面的图表表示：
